siRNA套装使用说明
一、产品简介:
常规化学合成siRNA为21-25nt的双链小分子RNA。即用型siRNA已经经过纯化、退火等处理,只要用RNase-Free water(DEPC水)溶解并配成20uM液体即可直接用于转染细胞。产品剂型为冻干粉,产品剂量经过严格测算标明摩尔数。
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套 装 内 容 |
数 量 |
规 格 |
分装管数 |
说 明 |
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目的基因siRNA |
3-4 |
2 0D |
2 |
针对目的基因设计的干扰 |
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GAPDH siRNA |
1 |
0.5 0D |
1 |
针对GAPDH的siRNA阳性对照 |
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N C |
1 |
0.5 0D |
1 |
negative control |
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FAM-N C |
1 |
0.5 0D |
1 |
荧光标记的NC对照 |
二、保存方法:
产品以冻干粉的形式,常温运输,常温下保存两周内稳定。收到产品后,请于-20℃至-80℃保存。
液体剂型的siRNA贮存浓度一般为20uM,应避免反复冻融(尽量不要超过5次),建议溶解后的产品分装保存,-80℃可稳定保存半年以上。如果近期不做实验,产品需长期放置最好以冻干粉形式保存,冻干粉剂型可在-20℃至-80℃保存一年以上。开盖前请先稍稍离心,将粉末收集于管底,再用RNase-Free water配置成20uM的液体剂型(每1nmol加50ul DEPC水)。
三、使用方法:
产品使用时,siRNA最好冰上放置,使用完毕后,请于-20℃或-80℃小心保存。整个过程要求无RNA酶环境,与产品接触的枪头、EP管等都应该经过无酶处理。特别提示:荧光标记siRNA(FAM-NC)要求避光保存,避光使用。
四、套装说明:
1.靶基因siRNA:套装中我们会按照siRNA设计原则设计合成3-4对siRNA,序列评分依次从高到低排列。
2.GAPDH siRNA :阳性对照组,在实验条件正确的情况下,转染GAPDH SiRNA的组份 GAPDH敲低效率qPCR检测应该在90%以上。
3.N C siRNA :negative control,阴性对照组,干扰效率计算时数值计算时该组定义为1。
4.FAM-N C siRNA :带绿色荧光基团的negative control组,检测转染效率时平行设置FAM-N C组(注意不是和其他组共转染),注意避光操作,6-12h荧光显微镜观察或流式检测siRNA的转染效率,平行设置的其他实验组的转染效率理论上与该组一致。
5.若您的套餐没有筛到一个有效的序列,请您提供您的详细实验信息和实验结果,包括:
6.细胞名称、转染试剂、转染条件(转染试剂与siRNA的配比、用量)、转染效率图、荧光定量PCR检测时间点(请标记数据对应的实验组)、实验重复次数等,我们技术人员会尽快分析您提供的信息并给出答复。
五、转染方法(以您使用 的转染试剂说明书为准)
siRNA转染的转染试剂种类繁多,siRNA相对于质粒分子量较小,使用RNAi专用的转染试剂转染效率更佳,可显著提升干扰效率,如RNAimax、NamipoTM等。
NamipoTM转 染 试 剂
使 用 说 明
A.5000转离心收集RNAi干粉于管底,根据siRNA的nmol数将其溶解于RNase-Free water ,震荡混匀配置成20μM母液,配置方法见附表一。
B.使用前请用振荡器轻微震荡5s混匀,如有少量沉淀属于正常现象,本品呈透明或乳白色均不影响产品品质。
C.根据使用量(参考附表一)将Namipo(μl)与siRNA母液(μl) 1:1混合,移液器轻轻吹打10次以上充分混匀,室温或4℃孵育10分钟。
D.按照使用量将Namipo-SiRNA复合物加入培养基,吹打5-10次混匀。转染前后培养基无需特殊处理,不需要特别换液。
F.转染后检测,若所转染的siRNA带有荧光标记,可在转染12小时后直接观察荧光计算转染效率。若siRNA不带荧光,转染24-48小时可通过qPCR检测待测基因的表达情况,由于siRNA的干扰效率存在差异,为了方便判断转染是否成功,可设置一组GAPDH的siRNA阳性对照作为判断依据。
附表一 配置20μM溶液用量表(siRNA合成后一般为干粉,根据提供的nmol数参照表格配置,过程中需要 RNase-Free环境)
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摩尔量 nmol |
0.5 |
1 |
2 |
5 |
10 |
20 |
|
溶解量(μL) |
25 |
50 |
100 |
250 |
500 |
1000 |
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各浓度siRNA用量表(20μM母液) |
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孔板 |
100nM |
50nM |
30nM |
20nM |
10nM |
每孔中总体积 |
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96-well |
0.5μL |
0.25μL |
0.15μL |
0.1μL |
0.05μL |
100μL |
|
24-well |
2.5μL |
1.25μL |
0.75μL |
0.5μL |
0.25μL |
500μL |
|
12-well |
5μL |
2.5μL |
1.5μL |
1μL |
0.5μL |
1000μL |
|
6-well |
10μL |
5μL |
3μL |
2μL |
1μL |
2000μL |
附表二 转染体积参考表(可根据细胞转染难易程度上下调整0.3倍的使用量。推荐的siRNA 转染浓度为60nM,即表格中数值)
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培养规格 皿/板 |
表面积 (cm2) |
培养液 (μL) |
D N A (μg) |
Namipo (μL) |
R N A i (μL) |
Namipo (μL) |
种板密度* (个/孔) |
|
96 well |
0.3 |
100μL |
0.3μg |
0.3μL |
0.3μL |
0.3μL |
0.5-4 *104 |
|
24 well |
2 |
500μL |
1.5μg |
1.5μL |
1.5μL |
1.5μL |
0.5-2*105 |
|
12 well |
4 |
1ml |
3.0μg |
3.0μL |
3.0μL |
3.0μL |
1-3*105 |
|
6 well |
10 |
2ml |
6.0μg |
6.0μL |
6.0μL |
6.0μL |
2-3*105 |
|
60 mm |
20 |
4ml |
12.0μg |
12.0μL |
12.0μL |
12.0μL |
8-10*105 |
